O Ensino Médio do Colégio da FSA procura desenvolver capacidades e habilidades contemporâneas. O foco é o aprimoramento cognitivo sem deixar de lado a condição do estudante pois, entendemos que não existe educação efetiva que não leve em conta o adolescente em seus contextos etário, familiar e social.

Neste sentido, a proposta pedagógica é norteada em dois eixos principais:

* Sólida formação acadêmico-científica que garante condições ao prosseguimento dos estudos em nível superior;

* Atividades variadas e interdisciplinares visando à compreensão do mundo e a sua participação ativa como cidadão;

Para tanto a escola conta com:

1. Corpo docente qualificado (Mestres, Doutores e Especialistas) com experiência e amplo domínio dos conteúdos;
2. Preocupação permanente com o aperfeiçoamento do processo de ensino-aprendizagem;
3. Atividades extraclasse voltadas à consolidação do saber adquirido;
4. Projetos pedagógicos com ênfase na pesquisa e no desenvolvimento da autonomia;
5. Utilização de equipamentos eletrônicos que permitem a pesquisa on-line dos conteúdos trabalhados em sala de aula;
6. Bolsa de Iniciação Científica Jr.
7. Parceria com a empresa Google e o uso de agregador de aplicativos educacionais;
8. Simulados e revisão com foco no ENEM e nos vestibulares;
9. Estudos de campo visando agregar prática e teoria;
10. Infraestrutura adequada ao desenvolvimento do ensino: salas de aula amplas, bem iluminadas e arejadas; laboratórios modernos de Biologia, de Física e de Química; ateliê e teatro projetados para as diversas artes;
11. Integração ao Centro Universitário com a realização de atividades e projetos conjuntos;
12. Biotério;
13. Biblioteca universitária;
14. Quadra esportiva;
15. Grêmio estudantil livre e independente visando ao aprimoramento do exercício da democracia, da participação e da representatividade;
16. Participação da comunidade (pais, alunos e funcionários da FSA) nos órgãos internos de decisão (Conselho Diretor e Conselho de Escola);
17. Espaço físico privilegiado no Campus da Universidade, que conta com 58 mil m² de área verde;